เหตุการณ์ภายหลังภาคแรก 3 ปีชูยะจัดตั้งกลุ่มกบฎและก็ขึ้นเป็นผู้นำก่อการสู้รบกับพวกคนแก่ กฏ BR ถูกนำกลับมาใช้อีกครั้งแบบโหดกว่าเดิม ชิโอริลูกสาวของครูคิตาโนะที่ถูกชูยะยิงตายไปเมื่อภาคที่แล้วต้องการค้นหาคำตอบเลยไปสมัครเรียนในสถานศึกษาที่มีเพียงแต่พวกเด็กเหลือขอ แล้วเด็กกลุ่มนั้นก็ถูกเลือกสรรมาเล่นเกมลักษณะเดียวกันกับพวกชูยะคือถูกพาตัวมาที่ค่ายจับสวมปลอกคอมีครูริกิที่ลูกสาวตายเนื่องจากว่าพวกชูยะก่อกบฏเป็นคนควบคุม เกมนี้ต่างจากภาคแรกคือให้จับแบบเป็นๆคู่ถ้าเกิดคู่ตายก็จำเป็นต้องถูกระเบิดตายตามไปด้วยและไม่ได้ให้ล่าคุ้นเคยแม้กระนั้นให้ตามล่าชูยะกับพวกกบฏบนเกาะที่พวกชูยะซ่อนตัวอยู่ เกมนรก สถาบันพันธุ์โหด 2
เริ่มภารกิจแรกยังไปไม่ทันถึงเกาะก็เริ่มถูกกลุ่มของชูยะเล่นงานตาย และก็ตายอีกในตอนที่ไปเก็บลูกกระสุนปืนที่ถูกส่งลงมาจากเรือบิน พวกเด็กนักเรียนตัวหลักๆคือทากุกับพวกที่เหลือถูกพวกชูยะล้อมไว้ พวกชูยะใช้ระเบิดทำลายระบบและก็ช่วยถอดปลอกใส่คอ ริกิส่งทหารเข้าไปแม้กระนั้นพวกชูยะจัดแจงได้ ชูยะกล่าวจนถึงกลุ่มเด็กนักเรียนยอมเป็นพวกด้วย อยู่ๆสหรัฐฯก็ยิงอาวุธลูกแรก นายกสั่งให้ริกิจัดแจงเก็บกวาดให้หมดทั้งเกาะริกิเองก็สวมปลอกคออยู่เช่นกัน ชูยะให้พวกเด็กนักเรียนหนีออกทางอุโมงค์ชิโอริไม่ยินยอมไปขออยู่ดูจนกระทั่งวินาทีในที่สุด ทากุกับเพื่อนอีกสองคนเปลี่ยนใจกลับมาสมทบกับชูยะ ริกิมาถึงบอกเรื่องที่ลูกถูกฆ่าในเหตุการก่อกบฏระเบิดที่ปลอกใส่คอริกิระเบิด ชิโอริถูกยิงเจ็บถามชูยะก่อนตายถึงโนริโกะชูยะบอกว่าโนริโกะเป็นผู้ที่กล้าสบตาและก็ยิ้มให้บุคคลอื่นอย่างจริงใจ ชูยะกับทากุบุกออกไปก่อนที่ทั้งเกาะจะถูกถล่มพวกทากุกับที่เหลือถูกประกาศว่าหายสาบสูญ ทากุกับชูยะตามมาสมทบกับพวกที่เหลือแล้วก็โนริโกะแล้วทั้งผองก็รวมตัวกันเดินหน้าต่อไป
